Recta final

Ya estamos en la recta final del programa, hace aproximadamente mes y medio se hizo una presentación de posters, e aquí tres de los posters que visité.

Detection of Antimicrobial Agent-Producing Microbes Via Whole-Cell and Molecular Techniques
Orlando Soto Cáceres. (UPRM)
El proyecto en si trata sobre microorganismos no cultivables capaces de producir antibióticos contra ciertos patógenos. Tomaron muestras de actinomicetos en Mayagüez, El Yunque y Cabo Rojo. Utilizaron técnicas moleculares y técnicas independientes de cultivo para observar producción de antibióticos. Una de las aportaciones mas grande de este proyecto lo es el encontrar nuevos antibióticos contras cepas de bacterias que ya han son resistentes a antibióticos que se encuentran ahora mismo en el mercado.

Effects of Confinement on Amyloid Fibril Formation
Melyorise Sepúlveda Chervony (UPRM)
Este proyecto va dirigido a la ingeniería biomédica. Se enfoca en las fibrillas producidas por los amiloides que causan enfermedades neurodegenerativas. Utilizan técnicas moleculares y bioquímicas para estudiar la formación de este fenómeno que es la formación de los amiloides. La gran aportación de este proyecto es el poder entender un poco mejor el porqué se forman dichos amiloides y que sucede exactamente con los axones y sus componentes de la neurona. Si podemos entender mejor como es que se forma y se comportan los amiloides se tiene una ventaja para poder encontrar una manera de arreglar o prevenir la formación de amiloides.

The Mechanism of Ag2S Nanocluster formation
Roy Suárez (UPRM)
Este proyecto va dirigido a la parte de neurociencias, mas bien en la degeneración de tejido neurológico. Se está tratando de hacer unos conductores artificiales de la reacción quicio-eléctrica que llevan a cabo las neuronas. Cuando una neurona pierde su función ocurre una laguna que impide el paso del impulso nervioso, lo que causa que los mensajes enviados nunca lleguen a su destino. Lo que se quiere lograr con este proyecto es crear unos conductores artificiales, conectarlos al axón de una neurona, saltar la neurona que no es viable y conectar este biomaterial a la próxima dendrita post-sináptica para que el impulso nervioso siga su camino y que el mensaje llegue a su destino.

Segundo mes de nuestro último semestre en BioMINDS

Hola a todos!!! Bueno ya han pasado dos meses de este semestre, nuestro último semestre en BioMINDS, pronto algunos se gradúan y se van a escuelas graduadas, otros se irán de internado de verano, en fin un sinnúmero de posibilidades para un sinnúmero de estudiantes talentosos. En cuanto a mi investigación me encuentro en el proceso de preparar los metales para luego hacer el ensayo de citotoxicidad. Por el momento he realizado aproximadamente un 30% de las metas propuestas para este semestre.

Recta final …

Saludos!!!!!!
Para este semestre estaré haciendo un ensayo de toxicidad que nos dirá si realmente los discos son tóxicos a los osteoblastos o es que la superficie es muy rugosa y no permite proliferación celular. Ya para finales de semestre se espera tener toda la “data” necesaria (junto con la data del estudiante graduado) para publicar el proyecto. Gracias al gran equipo de trabajo los resultados que se han obtenido han sido claros y fuertes como para hacer la publicación.
Una de las técnicas nuevas que utilizaré será un ensayo enzimático conocido como MTT. En este el “target enzime” es una enzima que se encuentra en el mitocondria, por tanto es un ensayo que nos permitirá analizar cuantitativamente las células viables que están presentes en cada muestra por medio de cambio en color en la muestra y medición de densidad óptica. El ensayo se realizará directa e indirectamente, es decir, con los metales presentes en cada muestra y utilizando un estracto (refiérase a medio con metal y luego utilizar ese mismo medio en células cultivadas sobre polietileno). Se espera que el metal control (Ti6Al4V) oxidado a 700 y 800°C sea tóxico a los osteoblastos, por consiguiente no habrá cambio en color cuando se realice el ensayo MTT.

En los semestres anteriores estuve trabajando con los discos Ti6Al4V y γ-TiAl y cultivando células de tejido óseo sobre la superficie de dichos metales, se quería analizar si estos eran tóxicos a los osteoblastos cuando previamente los metales habían sido oxidados termalmente. Surgió una interrogante, si es que por los óxidos que se formaban en la superficie de los metales al ser óxidados era que las células morían o era porque la superficie de los discos cambiaba y no permitía adhesión celular. Para contestar esta interrogante este semestre estaré trabajando con el ensayo que les expliqué anteriormente.

¡Ya pronto se termina el semestre!

Hola a tod@s:

Ya falta poco para que culmine el segundo semestre de esta jornada de BioMINDS. Ah sido un semestre irregular, puesto que hubo muchos días libres, días que no fueron con previo aviso y cuando se trata de investigaciones biológicas es un problema ya que los microorganismos con los que trabajas pueden morir si no le das el cuidado necesario. No sólo pasa con investigaciones biológicas, si no con todas esas investigaciones que tienen un horario ya establecido y cosas tan inesperadas como huelgas, problemas de luz o agua, eventos de la naturaleza como lo son los fenómenos atmosféricos interrumpen ese horario ya establecido y el proyecto de investigación se ve afectado. Ya para este momento yo tendría el ensayo de toxicidad terminado, con resultados, pero todo lo explicado anteriormente impidió que se realizara por completo, ya que este proyecto es nuevo.

Pero bueno si les puedo comentar sobre los resultados de la repetición que hice a principio de semestre del proyecto del semestre pasado. Al hacer un análisis de datos, pudimos concluir que la aleación de titanio Ti6Al4V es tóxico a los osteoblastos cuando es oxidado termalmente a 700 y 800°C, mientras que el γTiAl oxidado a 700 y 800°C no presentó muerte celular.

Para el semestre que viene estaré trabajando en otro proyecto relacionado a biomateriales, pero hasta el momento no tenemos claro lo que estaré haciendo.
¡Mucho éxito a todos en sus finales!

Mes de las brujaaaas …

Hola a tod@s!
Un mes menos de este arduo semestre, donde han ocurrido muchísimas cosas, días festivos, problemas  que han creado suspensión de clases. Pero bueno a lo que vinimos, hace un mes les comenté que ya había cumplido con un 80% del proyecto en general y que tenía que repetirlo para corroborar resultados. Puesto que fue la tercera vez que lo repetía mi mentora me indicó que no era necesario volver a repetirlo, por lo tanto lo único que me falta para culminar con el proyecto en sí es analizar los resultados junto al estudiante graduado con quien trabajo. Una de las aplicaciones científicas que aporta mi proyecto es que con los resultados obtenidos podemos concluir que la aleación Ti6Al4V es tóxico a los osteoblastos cuando es oxidado termalmente a 700°C y 800°C, mientas que el ϒTiAl no encontramos que es tóxico a la célula.
Por otro lado comenzaré con un proyecto nuevo el cual se enfoca en hacer un ensayo de citotoxicidad para analizar viabilidad celular. Lo que queremos observar y asegurarnos que la célula no crece por el tóxico que es generado por la aleación y no por la rugosidad de la superficie (cuando el metal se oxida la conformación de la superficie en Ti6Al4V cambia).

Ya pasó septiembre … sobrevivimos las lluvias !!!

¡Hola a todos!

Ya se fue septiembre y estamos sintiendo los efectos  porque es cuando comienza el primer examen de cualquier clase y nunca terminan los exámenes hasta el último día de clases. Al menos el tiempo va más rápido de lo que esperaba, además de que este mes hubo inclemencias por el mal tiempo, unos días extras para descansar (¡cabe destacar que tenemos que reponerlos!, colegiales si seguimos con tanto día libre despediremos el año en el Colegio!!!). Bueno ya pronto llega octubre, mitad de semestre, lo que significa que solo nos falta la mitad para terminar otra etapa de crecimiento en BioMINDS y terminar otro semestre de la universidad.

Algo que les quiero comentar, más bien darle una breve explicación es sobre una técnica que utilizo en el proyecto de investigación en el que me encuentro. Esta técnica tiene como nombre “Ensayo de hexosaminidasa”, algo raro el nombre, ¿no?. En palabras sencillas es un ensayo enzimático que se a basa en un cambio en color de una solucion y se lee con una máquina que mide densidad óptica. Hexosaminidasa es una enzima intracelular que se encuentra en los osteoblastos que utilizo para el cultivo de tejido sobre los metales de titanio. En resumen, se tiene en un plato de 96 fosas (no se utilizan todas las fosas puesto que serían demasiadas muestras) los discos de la aleación de titanio donde previamente se había hecho el cultivo de osteoblastos, estas fosas (donde hay muestras de discos) se lavan y luego se le añade una mezcla de una solución, detergente + sustrato, donde el detergente permeabiliza la membrana celular de los osteoblastos permitiendo que la enzima hexosaminidasa salga del interior de la célula al medio o mezcla (detergente+sustrato). Las células son incubadas a 37° C por un periodo de 1 hr.  Luego pasada la hora, se añade una solución que detiene el efecto del detergente. Este “stop solution” al ser añadido a las muestras ocurrirá un cambio en color (amarillo fluorescente) por reacción de la enzima mas el sustrato que contenía la solución. Habrá una relación directamente proporcional de la concentración de enzima en el medio con la intensidad de color, esto implica que a mayor concentración de la enzima, mayor será la intensidad del color, por  consiguiente mayor la cantidad de células que se encontraban adheridas al disco. Los discos se remueven de las fosas y el plato se coloca en un aparato que mide absorbancia o densidad óptica.

Hasta ahora eh logrado un 80% de los objetivos (4*) ya que terminé el experimento y todo salió bien. Para poder corroborar y comparar los resultados necesito repetir el experimento, el cual estaré trabajando en ello el próximo mes.

A pesar de que todo suena muy bonito, no todo esto es color rosa, puesto que nos encontramos en el camino piedritas que nos atrasan un poco o simplemente nos hacen el camino un poco difícil. Uno de los obstáculos que se me ha presentado es el que mi investigación al ser una colaboración entre dos ramas (Biología e Ingeniería Mecánica) para poder llevar a cabo el experimento tengo que utilizar facilidades de otro laboratorio en otro edificio que no es el de biología. Hay momentos en que los instrumentos que necesito utilizar no están disponibles y me tengo que regresar al laboratorio donde trabajo en biología sin poder hacer unas tareas muy importantes para con el proyecto. Esto es como todo, hay que tener mucha paciencia, si te gusta lo que estas haciendo no tendrás inconveniente alguno con volver otro día y hacer el trabajo investigativo.

Cuidense mucho y les estaré escribiendo el próximo mes!!!

Gente un nuevo semestre comienza!!!!

¡¡¡Saludos a tod@s!!!

Ya comienza un nuevo semestre con nuevas metas, nuevas clases y nuevos compañeros de laboratorio. Bueno creo que debería comenzar por las actividades que lleve a cabo en el periodo de verano. Sí, me quedé en PR trabajando en el laboratorio de investigación, aunque no tomé ningún curso me quedé de voluntario para adelantar el proceso de lo que es la preparación de los discos de titanio. No es una tarea fácil y menos cuando te encuentras solo en Mayagüez y ninguno de tus amigos más cercanos están, pero bueno así es la vida, hay que hacer sacrificios. Al menos no fue un sacrificio en vano para mí puesto que logré adelantar bastante.

En este nuevo semestre, las cosas se ponen un poquito apretaditas, ya  que estoy tomando el curso de Bioquímica y como TODOS sabemos es un poquito cuesta arriba, pero bueno ahí estamos lidiando con eso. En cuanto al proyecto de investigación, este semestre repetiré lo del semestre pasado, ya que debo tener unos datos más precisos y exactos porque se me dio la oportunidad de que mi trabajo lo publicaran en un “paper”, que es la vida y trabajo de los investigadores. El proyecto como tal, o sea el sembrado de tejido óseo sobre las superficie de dos aleaciones de titanio, para finales del semestre ya espero tener los resultados que necesito para aportar un granito de arena en el artículo que se escribirá. Los procedimientos son los mismos, usaré los mismos controles, las mismas técnicas y el mismo clon de osteoblasto. También ya a finales del semestre estaré comparando los resultados obtenidos con los del semestre pasado para así asegurarme de que todos los datos están bien. Por último, ya que culminaré con el proyecto de bioingeniería, quizá comenzaré en un proyecto de virología molecular, aunque aún no estamos muy seguros de ello.

Durante el semestre estaré informándoles de cómo va la investigación. Espero que tengan un buen semestre.

¡ÉXITO a TODOS!

Ya casi termina el primer semestre en BIOMINDS!!!!

¡Ya se termina el semestre! Luego de 4 arduos e interminables meses se termina el primer semestre de esta innovadora experiencia de investigación.  A lo largo de este semestre e aprendido que la mayor parte de ser exitoso está en ser perseverante y ser dedicado al proyecto. No siempre las cosas pasan como se espera que pasen, yo que trabajo en el ambiente biológico aprendí que siempre debemos estar preparados para cualquier resultado en la experimentación y preguntarnos el porqué de las cosas.

Para comenzar la investigación no hubo barrera o problema que no podía solucionarse. Me considero afortunado ya que en el laboratorio donde trabajo hay un gran equipo de investigadores y una comunicación efectiva entre estudiantes y mentor. Si hay que mencionar alguna barrer, les puedo comentar de que el tener un cultivo de osteoblastos bonito y saludable no es tan fácil como se piensa, hay que cambiarles el medio y ser bien cuidadosos para que no se contaminen. Suele pasar que aunque hagas todo con sumo cuidado un día que saques el cultivo para observarlo te das cuenta que está feo y se ve enfermo. En mi lenguaje yo las trato como mis “hijas”. Otra barrera, esta vez emocional, la desesperación de que algo no salga bien o que simplemente olvidaste un paso del protocolo a seguir por tener una mala organización, esto afecta el desempeño de nosotros como investigadores.

Para resolver estas barreras, ya sea el “problema” con el cultivo de tejido o el olvidar el protocolo es bueno tener una buena organización, escribir todo lo que se hace, documentar todos los resultados e interpretarlos al momento. Puede suceder, o mejor dicho siempre sucede que si dejas que pase mucho tiempo sin interpretar los resultados se puede olvidar muchas cosas claves que nos pueden decir exactamente lo que necesitamos.

El próximo semestre espero seguir trabajando en el laboratorio de virología molecular con la Dra. Diffoot, pero esta vez mi proyecto estará uniendo dos ramas muy interesantes, la bioingeniería con la biología molecular.

Nuevas técnicas aprendidas…. ¡De visita en diferentes blogs!

Hola a todos:               

          Ya ha pasado otro mes de investigación, pronto se acaban las clases y hay que acelerar nuestros proyectos. Así estamos todos batallando con los exámenes, con todo lo que nos exige la universidad y trabajando con nuestros proyectos en la investigación. ¿Qué es lo bueno de todo esto? Todas las experiencias que adquirimos durante el camino, esa obligación a tener una buena organización, y lo más importante el crecimiento de nuestro intelecto, tanto en el laboratorio como en nuestras clases y por supuesto en la vida cotidiana.            

            Las técnicas que e aprendido en el laboratorio han sido: pasaje de cultivo de tejido, conteo de células, ensayo enzimático, preparación de soluciones y medio, preparación de los discos (metales), etc. Todas estas técnicas las e utilizado durante todo este semestre. 

            Bueno ahora les hablaré sobre lo que ha pasado con mi investigación. Luego de hacer el sembrado de células en los discos de aleación de titanio (control y experimental) esperé un periodo de incubación de 14 días. Culminado el periodo de incubación proseguí con el ensayo enzimático para observar si hubo adhesión de células a los discos. Después de hacer el ensayo enzimático se utilizó el Micro Plate Reader para que calculara la absorbancia de cada muestra, ya que si había células adheridas al metal la solución se tornaría de color amarillo. Con los datos obtenidos se hace una grafica que contenga una línea de regresión, se obtiene los valores de la ecuación que nos da el programa (Excel) y se calcula una aproximación de la cantidad de células que habían adheridas al disco. Aun me encuentro en el proceso de hacer la grafica, hacer los cálculos y organizar los datos.                

              Por último les hablaré sobre los blogs que visité. En mi caso sólo pude visitar dos de los asignados porque tuve problemas para entrar a uno de los tres  que asignaron originalmente. Primero, uno de los blogs es de una estudiante de Cayey que su investigación consiste en la síntesis de nano pilares de óxido de zinc, es muy interesante porque a pesar de que no se relaciona con mi investigación pude comprender lo que ella está haciendo y me inspiró a seguir entrando a su blog para mantenerme al tanto de lo que esta sucediendo con su investigación. Por otro lado el segundo blog que visité lo es de una estudiante de biotecnología del Colegio (universidad en la que yo también me encuentro). Su trabajo es un poco más relacionado a lo mío, ya que es en el área biológica, en su caso ella está trabajando en la creación de unos plásmidos que en el gen de interés tenga una codificación para unas proteínas para luego transformar bacterias y hacer proteínas en masa. Estas tienen un fin muy importante en la parte clínica ya que se utilizarían para fines terapéuticos contra el cáncer.  

¡Hasta luego! 

Ya pasado un mes…

Este semestre estoy trabajando en un proyecto que está coordinado por la Dra. Diffoot (mi mentor) y el Dr. Sundaram (director de departamento de Ing. Mecánica). El proyecto se clasifica como bioingeniería el cual envuelve dos diferentes aleaciones de metales TiAlV6 y αTiAl (ingeniería mecánica) y osteoblastos (parte biológica). Buscamos ver la toxicidad de los metales oxidados a diferentes temperaturas y medir la adhesión de las células a la superficie de los metales. Para poder medir esto primero se cortan los metales en pequeños discos y luego se oxidan a diferentes temperaturas. En literatura se encuentra que TiAlV6 no es tóxico aún oxidado a altas temperaturas. Pero se quiere comparar la adhesión de las células en ambas aleaciones. La colaboración del grupo de trabajo es una muy buena y amena, ya que hay una comunicación efectiva y respeto entre los investigadores, tanto graduados como subgraduados. Durante este mes estuve trabajando tanto en el laboratorio de metalurgia en ingeniería mecánica para trabajar los metales como en el laboratorio de Virología Molecular para sembrar las células (cultivo de tejido). En el proceso de trabajar los metales y oxidarlos conté con la colaboración de mi compañera de laboratorio Yamilette López, ambos trabajamos en el laboratorio de metalurgia en el proceso de preparación de los metales (optimizarlos para el cultivo) y luego en el laboratorio de Virología para sembrar las células. También trabajo con la ayuda del estudiante graduado Samir A. Bello quien me ha enseñado todas las técnicas a utilizarse en el proyecto y los protocolos a seguir para trabajar en la investigación en si. Hasta el momento ya trabajé los metales y los coloqué en un plato de 42 fosas, luego sembré las células y los incubé a una temperatura de 33°C por 7 días luego los cambiaré a 39.5°C por 7 días mas. En estos momentos estoy esperando a que se cumplan los primeros 7 días para cambiarlos de temperatura, cambiándole el medio de cultivo cada dos días.